Nature|古代近東地區的農業起源
本文報道瞭 44 例古代近東人(ancient Near Easterners)的全基因組古 DNA，年代從公元前約 12,000 年到公元前 1,400 年不等，從Natufian狩獵采集者到青銅時代的農民。近東地區最早的人群約有一半的血統來自基底歐亞人（Basal Eurasian），其幾乎沒有尼安德特人的混閤，而且在其他非非洲群體分離之前，Basal Eurasian就已經分離瞭。南黎凡特（以色列和約旦）和紮格羅斯山脈（伊朗）的第一批農民在基因上有很大差異，他們都是當地狩獵采集者的後裔。到青銅時代，這兩個群體以及安納托利亞有關的農民，與歐洲的狩獵采集者混居，大大減少瞭遺傳分化。近東農民的影響超齣瞭近東地區：與安納托利亞有關的農民嚮西傳播到歐洲；與黎凡特農民有關的農民嚮南傳播到東非；與伊朗農民有關的農民嚮北擴張到歐亞大草原；同時與伊朗早期農民和歐亞草原牧民有關的民族嚮東擴張到南亞。
圖1 古西歐亞遺傳結構。
基底歐亞人和尼安德特人血統
使用f4(Test, Han; Ust’-Ishim, Chimp)檢驗基底歐亞血統。對於所有古代近東人以及新石器時代和後來的歐洲人來說，都是統計不顯著的負值（Z < -3.7），這與之前的假說是一緻的，他們的祖先來自歐亞大陸的一個深度分化的血統，並且在Han 和Ust’-Ishim分離之前就分離瞭齣來。使用qpAdm對Test群體進行模擬，發現來自伊朗和黎凡特的最早的群體具有最高的基底歐亞血統，這錶明基底歐亞血統廣泛分布於古代近東地區。在Test群體中基底歐亞祖先成分比例與尼安德特共享等位基因的比率之間存在負相關，這支持瞭西歐亞群體的尼安德特成分較東亞群體少的原因是其他血統的稀釋的假說。
圖2 基底歐亞血統解釋瞭西歐亞群體中尼安德特成分的減少。
古近東地區的極端分化
整個西歐亞大陸的人口分化程度較高，隨著時間的推移，分化程度逐漸降低。
圖3 西歐亞大陸的遺傳分化及其隨時間的顯著減少。
狩獵采集者和早期農民之間的連續性
本數據分彆發現瞭南黎凡特和南高加索-伊朗高原狩獵采集者與農民之間過渡時期的連續性。PCA、ADMIXTURE 和outgroup f3 分析中黎凡特狩獵采集者（納圖菲亞人）與黎凡特農民，以及伊朗和 CHG 與伊朗農民聚類在一起。
古代近東的混閤
本文分析錶明，伊朗舊石器時代、亞美尼亞舊石器時代、亞美尼亞青銅時代和安納托利亞舊石器時代的古代群體都是由相同的祖先成分組成的，盡管比例略有不同。
融入歐洲、東非和南亞
混閤不僅發生在近東地區，還延伸到瞭歐洲。在北方，一個與伊朗舊石器時代有關的人群貢獻瞭草原青銅時代早期人群祖先的大約 43%。在西邊，歐洲大陸的早期農民是新石器時代西北安納托利亞人的後裔。嚮西南方嚮遷徙，進入瞭東非人群，對於南亞的古北印度人（ANI），本文中無法將其建模成任何單一的古代人群，而是可以將其模擬為與伊朗西部早期農民和青銅時代歐亞大草原上的群體有關的祖先的混閤；所有取樣的南亞群體都被推斷為具有大量的這兩種祖先類型。
圖4 古西歐人、東非人、東歐人和南亞人的模型。
歐亞大陸西部及其以外地區的人口轉型
本文開發瞭一種方法，從未被發現的 "幽靈 "群體中推斷古代群體的存在和遺傳親緣關係。東歐亞人可以被模擬為沿著一條具有不同比例古北歐亞（ANE）祖先的cline排列，從美洲土著的40%到漢族的5%-10%ANE成分。東部狩獵采集者（EHG）大約四分之三的祖先來自 ANE，斯堪的納維亞狩獵采集者 (SHG) 是 EHG 和 WHG 的混閤體；而WHG 則是 EHG 和與瑞士舊石器時代晚期比丘人有關的人群的混閤。
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